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測序技術聯手捕獲肝癌免疫狀態

2019-11-02 04:26:33 來源:健康報
  (記者王瀟雨)10月31日,《細胞》雜志刊發由北京大學生物醫學前沿創新中心、北京未來基因診斷高精尖創新中心張澤民課題組聯合首都醫科大學附屬北京世紀壇醫院彭吉潤課題組等完成的研究成果,首次對肝癌臨床樣本進行包括病理組織在內的多組織位點的收集,并利用前沿的生物信息學分析方法,通過自體對照,描述了肝癌微環境的免疫組分和狀態,以及腫瘤浸潤免疫細胞跨組織的動態過程。

  “中國的肝癌發病率居世界之首,乙肝病毒的慢性感染則是導致肝癌發生發展的主要原因。”張澤民介紹,“現有研究表明,肝癌存在多種免疫逃逸機制,并與其所處的腫瘤微環境關系密切。研究肝炎病毒感染導致的慢性炎癥性腫瘤微環境中不同免疫細胞的狀態,具有重要意義。”

  該研究招募了16名肝細胞癌初治患者,這些患者術前未經任何放化療等輔助治療。研究人員通過手術獲取了癌組織等,收集到這些組織中的CD45+免疫細胞,并整合了10xGenomics和全長單細胞RNA測序技術,對這些免疫細胞進行了單細胞測序。

  研究人員發現了一群高表達LAMP3的新型樹突狀細胞,這群細胞可以從腫瘤遷移到肝周淋巴結,并表達多種免疫配體基因,具有與多種T淋巴細胞類型相互作用的潛力。研究同時發現,腫瘤中的巨噬細胞亞群表現出不同的轉錄狀態和向腹水轉移的能力。

  “腹水中含有大量髓系細胞,其產生與肝癌預后不良有關,但具體聯系尚未完全明確。我們發現,腹水中的髓系細胞和淋巴細胞分別主要來源于腫瘤和血液,但腫瘤來源的有增殖活性的T細胞往往傾向于在腹水中累積。”彭吉潤說,該結果為利用肝癌患者的腹水代替活檢組織進行腫瘤免疫狀態的監測提供了可能性依據,但仍需進一步探索。

  此外,張澤民介紹,不同的測序技術在細胞捕獲和基因捕獲上具有不同的優勢。結果發現,聯合使用10xGenomics和全長單細胞RNA測序技術進研究,或可成為相關研究策略之一。

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